Murat Aydın, 1960 yılında Giresun'un Piraziz ilçesine bağlı Bozat beldesinde doğdu.

İstanbul Üniversitesi İşletme Fakültesinden mezun olan Aydın, İstanbul Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü Maliye Bölümünde "Yerel Yönetimlerde Farklı Yaklaşımlar ve Sosyal Belediyecilik Uygulamaları" konulu teziyle yüksek lisansını tamamladı.

1999, 2004, 2009 ve 2014 yerel seçimlerinde Zeytinburnu Belediye Başkanı seçilen Aydın, Türk Dünyası Belediyeler Birliği Başkanvekilliği görevini yürütüyor.

2019 yerel seçimlerinde Beykoz Belediye Başkanı seçilen Aydın, İngilizce bilmekte olup, evli ve iki çocuk babasıdır.