Deniz Köken, 1964'te Ordu'da dünyaya geldi. 

Anadolu Üniversitesi İktisat Fakültesinden mezun olan Köken, yerel yönetim alanında çalışmalarına 1994'te Eyüpsultan Belediye Başkan Yardımcısı olarak başladı.

Deniz Köken, 1999-2002 yılları arasında İBB Meclis Üyeliği, İBB Bütçe Komisyonu Üyeliği ve İBB Tarife Komisyonu Başkanlığı görevini sürdürdü. 2009-2014 yılları arasında Erzurum Büyükşehir Belediyesi Genel Sekreteri olan Köken, 2014-2018 yılları arasında Gaziantep Büyükşehir Belediyesi Genel Sekreterliği görevini üstlendi, aynı zamanda Gaziantep OSB Yönetim Kurulu Başkanlığı yaptı. Köken, 2019 yerel seçimlerinde AK Parti'den Eyüpsultan Belediye Başkanı seçildi.

Köken, 3 çocuk babasıdır.