Mustafa Aydın, 1968 yılında Çorum'un Dodurga ilçesinde doğdu. İlk, orta ve lise tahsilini Dodurga’da tamamlayan Aydın, Anadolu Üniversitesi Sosyal Bilimler Bölümü ve Anadolu Üniversitesi İktisat Bölümünden mezun oldu. 1991 yılında polislik meslek hayatına başlayan Aydın, istifa ederek 2004 yılında AK Parti'den Dodurga Belediye Başkanlığına seçildi. 2009 yılında AK Parti'den yeniden aday gösterilen Aydın, kazanamayınca memurluk görevine geri döndü. 2014 yılında Demokrat Parti'den Dodurga Belediye Başkanı seçilen
Aydın, bir süre sonra partisinden istifa ederek AK Parti'ye katıldı. AK Parti'den yeniden aday gösterilen Aydın, evli ve 2 çocuk babasıdır.